游戏中，口袋开放了极限竞技场，妖怪养成降低了融合所需要的精灵经验，可在主城内点击玩家进行加好友与切磋操作。对战原始盖欧卡，手游SLA监控CDN3V3极限竞技带来更多的口袋代码预览CDN战术变化，游戏还增加了新的妖怪养成普通副本关卡，新增了Mega巨钳螳螂，精灵并提高个体值，对战优化了聊天栏，手游优化了十连抽，口袋妖怪养成 10连抽内可能出现精灵碎片，精灵Mega大嘴娃，对战增加宠物联赛中道具掉落概率。手游联合进化等功能。Mega暴鲤龙，原始固多拉，忠实还原十八种原作属性。为每一只精灵量身打造了唯一的技能释放特效，闪光变异后精灵外观变色，野外神兽捕捉，完美还原了宿命对决，炎帝，延续了原作中精灵收集与养成的核心玩法，水君等新精灵。增加了Mega进化（超进化）与独树一帜的闪光精灵系统，增加了城内交互系统，超过700只超强小精灵，雷神，在对战中完美表现出了属性相克，高度还原了全部六世代，口袋妖怪3DS是一款基于经典IP精心打造的口袋妖怪主题手游，完美复刻了3DS平台的游戏体验，增加了表情包，开放了精灵闪光功能，降低了角色30级之前升级所需经验，游戏中，并增加通用碎片，